36氪获悉，AI蛋白质设计平台「分子之心」近日完成超亿元战略融资，由合成生物学上市公司凯赛生物（688065.SH）领投，联想创投跟投，天使轮领投方红杉中国追加投资。本轮融资将用于AI蛋白质优化与设计平台MoleculeOS开发，探索平台能力在生物制药、合成生物学等产业的应用。这是分子之心成立一年内获得的第二轮投资。
本轮投资的领投方凯赛生物，是国内合成生物学领域的代表企业，其开发的生物法长链二元酸系列产品，国际市场占有率约80%，客户包括杜邦、艾曼斯、诺和诺德等。另外，凯赛生物的生物法癸二酸、生物基戊二胺、生物基聚酰胺等产品具备万吨级产能，规划在建产能数十万吨。
企业供图
“凯赛生物产业化项目，证明了合成生物学技术可以做出比化工方法更有竞争力的产品，”凯赛生物董事长刘修才表示，“本次凯赛与分子之心合作，将AI技术引入生物制造研发体系，从科学源头出发，提高新技术、新产品的研究效率。”
分子之心由许锦波教授创建，在中、美两地设有研发中心，组建了由计算生物专家组成的团队，普遍具备海外名校研修背景。许锦波现任美国芝加哥丰田计算技术研究所教授、清华大学智能产业研究院 (AIR) 访问教授，在AI蛋白质预测与设计领域研究多年。其于2016年研发的RaptorX-Contact方法，首次证明深度学习可以大幅提高蛋白质结构预测的精度，后被DeepMind借鉴。
由分子之心自研的AI蛋白质优化与设计平台MoleculeOS，通过数据驱动的深度学习算法，通过分析蛋白质的表达性、稳定性、成药性等，帮助行业专家识别合适的蛋白质，或可直接设计和生成所需要的蛋白质，加速实验室成果的产业转化。
企业供图
基于识别、改造、从头设计合适蛋白质的能力，该平台将用于多肽、抗体、酶和小蛋白的设计研究，令大分子创新药研发趋近于可编程、可预测。除了生物药的研发，AI大分子优化与设计平台也被运用到合成生物学，例如，制造可再生生物燃料，解决能源和环境问题；或是用AI打造新的、具有稳定功能的工业酶等。
“分子之心具备AI蛋白质技术，凯赛生物拥有完整的产业布局、多条产品线。双方合作能够令AI蛋白技术深入应用于合成生物学领域，带动生物制造的智能化升级，以开发更具市场、环保等方面价值的新材料，”分子之心创始人许锦波表示。
据了解，当前分子之心的算法可应用于在蛋白质及复合物结构预测、蛋白质从头设计、蛋白质功能预测等方面。举例而言，其在AI单序列蛋白质结构预测上取得了一定突破。经过近年的研究，学界和产业界已有共识：深度学习对蛋白质结构预测的提升有显著效果，可准确预测大部分蛋白质三维空间的大致形状。但业内多种AI算法均存在一个缺陷，即在预测中，高度依赖MSA（来自同源蛋白质的多序列比对），及其衍生的共同进化信息和序列谱。由此，“不使用同源序列和共进化信息的AI蛋白质预测方法”成为业界关注的方向。
基于MoleculeOS平台，分子之心提出AI单序列蛋白质结构预测算法，在不使用MSA的情况下，从一级序列直接预测蛋白质结构；同时所采用的模型及参数更为轻量。该算法有望拓展蛋白质结构预测的探索效率和应用边界。
当前，AIGC领域的ChatGPT潜力被挖掘、认可，业内对生成式AI的关注达到新高度。在生命科学领域，通过AI算法从头设计生成蛋白质，近年来不断出现技术突破，新型蛋白质也被用于抗体、多肽等新药研发及合成生物学领域。当前，国内正陆续涌现出多家创业公司，36氪将持续关注这一领域的动态与进展。
参考阅读：
36氪首发 | 研发AI蛋白质优化与设计平台，「分子之心」完成数千万美元天使轮融资
